na nota de encomenda podes colocar uma coluna com o stock existente (assim visualmente sabe se tem stock ou nao)...

caso nao seja isso o pretendido poderá ser feita essa automação via SQL, mas já envolve desenvolvimento

Obrigado a questão era mesmo evitar a verificação manual. 

Forma mais simples seria criar um script que iria alimentar o campo "Mensagem de aviso" da ficha do artigo...

ao vender poderia mostrar a mensagem com algo do tipo

Pois queria um aviso que notifica quando o stock muda de 0 para 1, para tratar das encomendas pendentes, uma vez feita a reposição de stock. Onde introduzo o script?

tem de ser criado, terá de pedir ao seu parceiro que crie

A mensagem no artigo não nos interessa. Queremos uma forma de notificar o vendedor que criou a nota de encomenda que já entrou stock esperado para então faturar manualmente. 

Smartools, já existe solucao para todas essa notificacoes 

Como posso obter mais informação sobre isso? Procurei e não encontrei.