Buenas tardes Jose Luis,

En primer lugar asegúrate de disponer de la última versión de la aplicación (50.0.7670.1.26 en Ayuda - Acerca de) y de Modelos fiscales (32.40 al acceder a Modelos - Configuración de modelos fiscales) antes de realizar cualquier comprobación de datos.

Por otro lado, comentarte que si estás obteniendo un cuadro resumen de IVA, en él se te mostrará la información de las distintas operaciones realizadas con cada tipo de IVA, reflejando la base imponible y el importe de IVA correspondiente a lo introducido en cada cuadro de impuestos de los asientos contables, por lo que si detectas alguna incidencia, no dudes en ponerte en contacto con el departamento técnico para que te puedan guiar si lo necesitas en esas comprobaciones.

Saludos!