Hola Diego,  complementando lo que comenta Jose Luis: si el tipo de asiento tiene marcado el flag "IVA al devengo" (VAT), X3 considerará todos los asientos creados con ese tipo al lanzar la función Generación Declaración. Si no se quiere que aparezcan esos avisos porque los usuarios ya son conscientes de que no hay factura contabilizada, utiliza un tipo de asiento que no lleve gestión de impuestos para contabilizar esas operaciones. 

Hola Diego,  complementando lo que comenta Jose Luis: si el tipo de asiento tiene marcado el flag "IVA al devengo" (VAT), X3 considerará todos los asientos creados con ese tipo al lanzar la función Generación Declaración. Si no se quiere que aparezcan esos avisos porque los usuarios ya son conscientes de que no hay factura contabilizada, utiliza un tipo de asiento que no lleve gestión de impuestos para contabilizar esas operaciones. 

Muchas gracias por la aclaración Belén